Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Med16Q6PGF3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Med16Q6PGF3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Med16Q6PGF3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Med16Q6PGF3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms