Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B9

Rbfa, Putative ribosome-binding factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RbfaQ6P3B9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RbfaQ6P3B9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RbfaQ6P3B9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RbfaQ6P3B9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RbfaQ6P3B9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RbfaQ6P3B9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms