Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1G2

Kdm2b, Lysine-specific demethylase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2bQ6P1G2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Kdm2bQ6P1G2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Kdm2bQ6P1G2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Kdm2bQ6P1G2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kdm2bQ6P1G2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kdm2bQ6P1G2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms