Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PrimpolQ6P1E7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PrimpolQ6P1E7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PrimpolQ6P1E7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PrimpolQ6P1E7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PrimpolQ6P1E7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms