Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hdac4Q6NZM9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Hdac4Q6NZM9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Hdac4Q6NZM9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hdac4Q6NZM9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms