Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gpbp1Q6NXH3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Gpbp1Q6NXH3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gpbp1Q6NXH3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms