Protein–RNA interactions for Protein: Q6NV83

U2surp, U2 snRNP-associated SURP motif-containing protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2surpQ6NV83 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
U2surpQ6NV83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
U2surpQ6NV83 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
U2surpQ6NV83 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
U2surpQ6NV83 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
U2surpQ6NV83 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms