Protein–RNA interactions for Protein: Q6IMF0

Krt87, Keratin, type II cuticular 87, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt87Q6IMF0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Krt87Q6IMF0 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Krt87Q6IMF0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Krt87Q6IMF0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Krt87Q6IMF0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt87Q6IMF0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt87Q6IMF0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Krt87Q6IMF0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krt87Q6IMF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms