Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Hecw2Q6I6G8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Hecw2Q6I6G8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Hecw2Q6I6G8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Hecw2Q6I6G8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Hecw2Q6I6G8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Hecw2Q6I6G8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms