Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Scaf8Q6DID3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Scaf8Q6DID3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Scaf8Q6DID3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Scaf8Q6DID3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Scaf8Q6DID3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms