Protein–RNA interactions for Protein: Q6A037

N4bp1, NEDD4-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4bp1Q6A037 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
N4bp1Q6A037 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
N4bp1Q6A037 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
N4bp1Q6A037 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
N4bp1Q6A037 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms