Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZJ7

Ric1, RAB6A-GEF complex partner protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ric1Q69ZJ7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ric1Q69ZJ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ric1Q69ZJ7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ric1Q69ZJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ric1Q69ZJ7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ric1Q69ZJ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms