Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZF8

Msl2, E3 ubiquitin-protein ligase MSL2, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msl2Q69ZF8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Msl2Q69ZF8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Msl2Q69ZF8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Msl2Q69ZF8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms