Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atg9aQ68FE2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Atg9aQ68FE2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atg9aQ68FE2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Atg9aQ68FE2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms