Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Knl1Q66JQ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Knl1Q66JQ7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Knl1Q66JQ7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Knl1Q66JQ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Knl1Q66JQ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Knl1Q66JQ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Knl1Q66JQ7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Knl1Q66JQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms