Protein–RNA interactions for Protein: Q64524

Hist2h2be, Histone H2B type 2-E, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hist2h2beQ64524 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hist2h2beQ64524 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hist2h2beQ64524 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hist2h2beQ64524 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms