Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sf1Q64213 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Sf1Q64213 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sf1Q64213 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms