Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim24Q64127 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim24Q64127 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim24Q64127 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms