Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pan3Q640Q5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pan3Q640Q5 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pan3Q640Q5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pan3Q640Q5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms