Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Zic3Q62521 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zic3Q62521 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Zic3Q62521 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms