Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ndufa4Q62425 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ndufa4Q62425 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndufa4Q62425 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndufa4Q62425 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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