Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hoxa13Q62424 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hoxa13Q62424 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Hoxa13Q62424 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hoxa13Q62424 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hoxa13Q62424 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms