Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccl12Q62401 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccl12Q62401 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccl12Q62401 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms