Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tff3Q62395 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tff3Q62395 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Tff3Q62395 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tff3Q62395 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms