Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC43.05■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC43.04■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Kdm5dQ62240 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC42.98■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC42.98■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
Kdm5dQ62240 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC42.93■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC42.9■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC42.88■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.46
Kdm5dQ62240 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.83■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
Kdm5dQ62240 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Kdm5dQ62240 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
Kdm5dQ62240 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.68■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC42.65■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Kdm5dQ62240 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.6■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Kdm5dQ62240 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.9 ms