Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PtprrQ62132 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PtprrQ62132 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PtprrQ62132 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PtprrQ62132 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms