Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lama3Q61789 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lama3Q61789 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lama3Q61789 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lama3Q61789 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms