Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik5Q61626 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik5Q61626 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Grik5Q61626 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik5Q61626 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik5Q61626 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Grik5Q61626 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik5Q61626 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grik5Q61626 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik5Q61626 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik5Q61626 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms