Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Smarcd1Q61466 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smarcd1Q61466 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Smarcd1Q61466 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Smarcd1Q61466 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms