Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AcanQ61282 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
AcanQ61282 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
AcanQ61282 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
AcanQ61282 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
AcanQ61282 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AcanQ61282 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AcanQ61282 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AcanQ61282 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms