Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mre11Q61216 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Mre11Q61216 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Mre11Q61216 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mre11Q61216 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mre11Q61216 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms