Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gbp4Q61107 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gbp4Q61107 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gbp4Q61107 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms