Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Lamb3Q61087 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lamb3Q61087 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lamb3Q61087 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lamb3Q61087 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lamb3Q61087 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms