Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Traf3Q60803 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Traf3Q60803 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Traf3Q60803 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3Q60803 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3Q60803 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3Q60803 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3Q60803 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Traf3Q60803 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Traf3Q60803 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms