Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Psmb6Q60692 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Psmb6Q60692 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Psmb6Q60692 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Psmb6Q60692 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms