Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C1

Gprasp1, G-protein coupled receptor-associated sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gprasp1Q5U4C1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Gprasp1Q5U4C1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Gprasp1Q5U4C1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Gprasp1Q5U4C1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Gprasp1Q5U4C1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Gprasp1Q5U4C1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.4 ms