Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc125Q5U465 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc125Q5U465 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ccdc125Q5U465 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ccdc125Q5U465 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms