Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
AbrQ5SSL4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AbrQ5SSL4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
AbrQ5SSL4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
AbrQ5SSL4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms