Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc85aQ5SP85 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc85aQ5SP85 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc85aQ5SP85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc85aQ5SP85 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms