Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rtp3Q5QGU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rtp3Q5QGU6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Rtp3Q5QGU6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms