Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Scarf1Q5ND28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scarf1Q5ND28 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scarf1Q5ND28 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scarf1Q5ND28 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms