Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Trappc1Q5NCF2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trappc1Q5NCF2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trappc1Q5NCF2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms