Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC41

1810065E05Rik, RIKEN cDNA 1810065E05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1810065E05RikQ5NC41 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
1810065E05RikQ5NC41 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
1810065E05RikQ5NC41 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
1810065E05RikQ5NC41 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.56■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
1810065E05RikQ5NC41 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
1810065E05RikQ5NC41 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms