Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps41Q5KU39 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps41Q5KU39 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Vps41Q5KU39 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Vps41Q5KU39 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms