Protein–RNA interactions for Protein: Q5IBH6

Spdye4a, Speedy protein E4A, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdye4aQ5IBH6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Spdye4aQ5IBH6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Spdye4aQ5IBH6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Spdye4aQ5IBH6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Spdye4aQ5IBH6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms