Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frem3Q5H8B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frem3Q5H8B9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Frem3Q5H8B9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Frem3Q5H8B9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Frem3Q5H8B9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Frem3Q5H8B9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Frem3Q5H8B9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms