Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTU0

Afap1l2, Actin filament-associated protein 1-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afap1l2Q5DTU0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Afap1l2Q5DTU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Afap1l2Q5DTU0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Afap1l2Q5DTU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Afap1l2Q5DTU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms