Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Prss53Q571E5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prss53Q571E5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prss53Q571E5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prss53Q571E5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms