Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Znf608Q56A10 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Znf608Q56A10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Znf608Q56A10 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.05
Znf608Q56A10 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Znf608Q56A10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Znf608Q56A10 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Znf608Q56A10 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Znf608Q56A10 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms