Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pacs2Q3V3Q7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pacs2Q3V3Q7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pacs2Q3V3Q7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms